Puisque le domaine du mail touche au domaine de la communication sur Internet, de nombreux protocoles de communications sont nécessaires :
Lors de l’envoi d’un mail, ou lorsque celui-ci transite de MTA en MTA, la communication s’effectue via le protocole SMTP sur le port 25.
Lors de la réception d’un mail par le MTA de bout-de-chaîne, celui-ci le délivre au MDA via le protocole LMTP sur le port 24.
Lors de la consultation de ses mails (via un client de messagerie1) ou via un webmail), l’utilisateur peut se connecter au MDA via le protocole IMAP sur le port 143 ou les consulter sur sa machine, après qu’ils aient été récupérés via le protocole POP.